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Die Internationale Wasservogelzählung ist das großräumigste und am längsten laufende Monitoringprogramm. Auch in Sachsen-Anhalt werden seit Ende der 1960er Jahre regelmäßig die rastenden und überwinternden Wasservogelbestände erfasst. Bis zur Zählsaison 2002/2003 koordinierte die Pädagogische Hochschule Potsdam bzw. der Förderverein für Wasservogelökologie und Feuchtgebietsschutz, welche die Daten für Ostdeutschland zusammenführten, die Zählungen in Sachsen-Anhalt. Deutschlandweit werden die Erfassungen durch den Dachverband Deutscher Avifaunisten koordiniert und ausgewertet. Mit der Zählperiode 2003/2004 übernahm der Ornithologenverband Sachsen-Anhalt, durch das Landesamt für Umweltschutz finanziell gefördert, die Koordination der Wasservogelzählung im Land Sachsen-Anhalt.
Die Erfassung der Wasservögel erfolgt im Winterhalbjahr zwischen Oktober und März jeweils am Wochenende zur Monatsmitte. Seit einigen Jahren wird - zumindest an den Standgewässern - auch im September und April gezählt. Die Zählungen in Halle und Umgebung wurden über viele Jahre durch W. Wischof (ehemaliger Saalkreis) und K. Liedel (Halle und Mansfelder Seen) koordiniert, seit einigen Jahren ist L. Müller als Koordinator für den Ornithologischen Verein Halle für die Zählungen in Halle und Umgebung tätig. Die Ergebnisse der Zählungen im November, Januar und März fließen in das Europäische Wasservogelmonitoring ein.
Nachdem zunächst ausschießlich Taucher, Kormorane, Reiher, Schwäne, Gänse, Enten und Rallen gezählt wurden, werden in den letzten Jahren außerdem auch Limikolen, Möwen und Seeschwalben, Greifvögel und andere Arten der Gewässer und Feuchtgebiete erfasst. Pro Zählsaison werden so in Halle und Umgebung ca. 100.000 Vögel erfasst.
Die am häufigsten gezählten Wasservögel (in abnehmender Reihenfolge) sind Stockente (Anas platyrhynchos) - 20.000 bis 25.000 Vögel pro Zählsaison, Blässhuhn (Fulica atra) - reichlich 20.000 Vögel pro Saison, Lachmöwe (Larus ridibundus) - 15.000 bis 20.000 Vögel pro Saison, Sturmmöwe (Larus canus), Saatgans (Anser fabalis), Reiherente (Aythya fuligula), Tafelente (Aythya ferina) und Kormoran (Phalacrocorax carbo).
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